Профиль магистратуры «Водоотведение и очистка сточных вод» является продолжением профиля бакалавриата «Водоснабжение и водоотведение». Выпускники могут занимать должности: специалисты в области водоснабжения и водоотведения; специалисты в проектных организациях, строительно-монтажных и эксплуатационных компаниях в качестве проектировщика внутренних и наружных инженерных систем; мастера, производители работ, начальник участка; инженер по эксплуатации инженерных систем и оборудования; зам. директора, главного инженера и т. д.